En un día brillante y tranquilo, los hermanos Nunnally y Lelouch Lamperouge se toman un momento para relajarse bajo un árbol. Cuando Nunnally le pide que le cuente una historia, Lelouch, quien está resuelto a hacer todo lo posible por su hermana, hace un uso único de su habilidad de Geass, rompiendo barreras para contar la historia más entretenida que pueda. Despertando solo debajo del árbol, la anteriormente ciega Nunnally encuentra que puede ver de nuevo e inmediatamente ve un extraño conejo que se parece a Anya Alstreim, el Caballero de los Seis. La vista de este conejo envía a Nunnally a caer en un agujero, llevándola a un colorido país de las maravillas. Narrado por el propio Lelouch, Code Geass: Hangyaku no Lelouch – Nunnally en Wonderland sigue a los perdidos Nunnally mientras busca un camino de regreso a casa, conociendo a un montón de personajes coloridos y familiares en el camino.
